Il transetto di sinistra è ornato da un grandioso altare barocco dedicato alla Madonna del Rosario e appartenuto alla omonima Confraternita. È formato da una nicchia in legno sostenute da quattro colonne tortili, coronate da festoni e pennacchi. Ai lati dell’altare due grandi candelabri incisi con stemmi gentilizi e datati 1719.
Alla parete sinistra del transetto vi è una tempera anonima raffigurante San Biagio fra i santi Bartolomeo e Antonio abate (1580), proveniente dalla Pieve di S. Michele; accanto la tela del santarcangiolese Giovan Battista Galliadi (1749-1805) con la Crocifissione con due sante monache, di cui non conosciamo la provenienza.
Attualmente il transetto sinistro della Collegiata è in restauro.